生命知源表观遗传学平台之MSP/BSP

MSP其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因组DNA,未甲基化的胞嘧啶(C)变成尿嘧啶(U),而甲基化的胞嘧啶不变,基于这种碱基的改变,然后根据甲基化位点设计针对甲基化和非甲基化序
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产品概述

        MSP其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因组DNA,未甲基化的胞嘧啶(C)变成尿嘧啶(U),而甲基化的胞嘧啶不变,基于这种碱基的改变,然后根据甲基化位点设计针对甲基化和非甲基化序列的引物并进行聚合酶链反应(PCR)扩增,最后通过琼脂糖凝胶电泳分析,确定与引物互补的DNA序列的甲基化状态。MSP只能获得该样本是否发生甲基化的信息。
        BSP的基本原理是?亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发?甲基化的胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶(U),?甲基化的胞嘧啶不变。随后再CpG岛两端设计引物进?PCR,将?的产物纯化后进?TA克隆,每个克隆挑取阳性克隆测序,最后将测得的序列与原始序列?对,统计甲基化位点及数量,并分析甲基化程度。BSP则可以详细了解每一个CpG位点的甲基化情况。



 
项目流程:
基因组DNA提取并定量→亚硫酸氢钠修饰→DNA修饰纯化后回收→引物设计合成→PCR检测→琼脂糖凝胶电泳(MSP)/产物克隆测序(BSP)

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